Penyaringan secara berkomputer elemen LTR retrotransposon di dalam genom manusia
Tujuan kajian ini adalah untuk menyaring retroelemen Gypsy dan Del daripada serangga Drosophila Melanogaster di dalam genom manusia. Retroelemen adalah eIemen bergerak yang mengandungi gen transkriptase berbalik. Elemen yang menggunakan perantara RNA ini boleh menyebabkan ketakstabilan genetik melal...
Saved in:
Main Author: | |
---|---|
Format: | Academic Exercise |
Language: | English |
Published: |
2007
|
Online Access: | https://eprints.ums.edu.my/id/eprint/7824/1/ae0000001657.pdf https://eprints.ums.edu.my/id/eprint/7824/ |
Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
id |
my.ums.eprints.7824 |
---|---|
record_format |
eprints |
spelling |
my.ums.eprints.78242017-10-10T06:28:22Z https://eprints.ums.edu.my/id/eprint/7824/ Penyaringan secara berkomputer elemen LTR retrotransposon di dalam genom manusia Nurul Hidayah Mohamed Isa Tujuan kajian ini adalah untuk menyaring retroelemen Gypsy dan Del daripada serangga Drosophila Melanogaster di dalam genom manusia. Retroelemen adalah eIemen bergerak yang mengandungi gen transkriptase berbalik. Elemen yang menggunakan perantara RNA ini boleh menyebabkan ketakstabilan genetik melalui mutasi penyisipan dan mutasi lain. Kaedah penyaringan yang digunakan adalah secara berkomputer. Retroelemen tersebut disaring di dalarn pangkalan data manusia. Retroelemen yang dipilih disusun dengan menggunakan dua cara; cara manual (penyusunan mata kasar) dan cara berkomputer (program c1ustalw). Pokok filogenetik khusus digunakan untuk melihat hubungan evolusi antara prob yang digunakan dengan retroelemen lain. Pokok ftlogeni universal pula digunakan untuk melihat hubungan antara retroelemen dan retrovirus. Daripada kajian sebanyak 773 elemen Gypsy dan 773 e1emen Del berjaya dipancing keluar daripada bank gen. Daripada jumlah ini hanya 100 e1emen Gypsy dan 100 e1emen Del dipertimbangkan. 28 elemen Gypsy dan 21 elemen Del disusun secara manual. Hanya 13 e1emen Gypsy dan 8 elemen Del disusun dengan menggunakan program clustalw dan pembinaan pokok filogenetik. Keputusan yang diperolehi daripada kajian ini menunjukkan retrolemen Gypsy dan Del pada serangga Drosophila Melanogaster ini telah dijumpai dalarn genom manusia. Kedua-dua elemen ini paling banyak didapati pada kromosom seks,X. Selain itu elemen-elemen ini turnt didapati dalam bilangan yang tinggi dalam kromosom autosom. Elemen Gypsy dijumpai di dalam kromosom pertama dan kedua. Elemen Del pula banyak terdapat pada kromosom kelima dan ketujuh. 2007 Academic Exercise NonPeerReviewed text en https://eprints.ums.edu.my/id/eprint/7824/1/ae0000001657.pdf Nurul Hidayah Mohamed Isa (2007) Penyaringan secara berkomputer elemen LTR retrotransposon di dalam genom manusia. Universiti Malaysia Sabah. (Unpublished) |
institution |
Universiti Malaysia Sabah |
building |
UMS Library |
collection |
Institutional Repository |
continent |
Asia |
country |
Malaysia |
content_provider |
Universiti Malaysia Sabah |
content_source |
UMS Institutional Repository |
url_provider |
http://eprints.ums.edu.my/ |
language |
English |
description |
Tujuan kajian ini adalah untuk menyaring retroelemen Gypsy dan Del daripada serangga Drosophila Melanogaster di dalam genom manusia. Retroelemen adalah eIemen bergerak yang mengandungi gen transkriptase berbalik. Elemen yang menggunakan perantara RNA ini boleh menyebabkan ketakstabilan genetik melalui mutasi penyisipan dan mutasi lain. Kaedah penyaringan yang digunakan adalah secara berkomputer. Retroelemen tersebut disaring di dalarn pangkalan data manusia. Retroelemen yang dipilih disusun dengan menggunakan dua cara; cara manual (penyusunan mata kasar) dan cara
berkomputer (program c1ustalw). Pokok filogenetik khusus digunakan untuk melihat hubungan evolusi antara prob yang digunakan dengan retroelemen lain. Pokok ftlogeni
universal pula digunakan untuk melihat hubungan antara retroelemen dan retrovirus. Daripada kajian sebanyak 773 elemen Gypsy dan 773 e1emen Del berjaya dipancing
keluar daripada bank gen. Daripada jumlah ini hanya 100 e1emen Gypsy dan 100 e1emen Del dipertimbangkan. 28 elemen Gypsy dan 21 elemen Del disusun secara manual. Hanya
13 e1emen Gypsy dan 8 elemen Del disusun dengan menggunakan program clustalw dan pembinaan pokok filogenetik. Keputusan yang diperolehi daripada kajian ini menunjukkan retrolemen Gypsy dan Del pada serangga Drosophila Melanogaster ini
telah dijumpai dalarn genom manusia. Kedua-dua elemen ini paling banyak didapati pada kromosom seks,X. Selain itu elemen-elemen ini turnt didapati dalam bilangan yang tinggi
dalam kromosom autosom. Elemen Gypsy dijumpai di dalam kromosom pertama dan kedua. Elemen Del pula banyak terdapat pada kromosom kelima dan ketujuh. |
format |
Academic Exercise |
author |
Nurul Hidayah Mohamed Isa |
spellingShingle |
Nurul Hidayah Mohamed Isa Penyaringan secara berkomputer elemen LTR retrotransposon di dalam genom manusia |
author_facet |
Nurul Hidayah Mohamed Isa |
author_sort |
Nurul Hidayah Mohamed Isa |
title |
Penyaringan secara berkomputer elemen LTR retrotransposon di dalam genom manusia |
title_short |
Penyaringan secara berkomputer elemen LTR retrotransposon di dalam genom manusia |
title_full |
Penyaringan secara berkomputer elemen LTR retrotransposon di dalam genom manusia |
title_fullStr |
Penyaringan secara berkomputer elemen LTR retrotransposon di dalam genom manusia |
title_full_unstemmed |
Penyaringan secara berkomputer elemen LTR retrotransposon di dalam genom manusia |
title_sort |
penyaringan secara berkomputer elemen ltr retrotransposon di dalam genom manusia |
publishDate |
2007 |
url |
https://eprints.ums.edu.my/id/eprint/7824/1/ae0000001657.pdf https://eprints.ums.edu.my/id/eprint/7824/ |
_version_ |
1760229225981280256 |
score |
13.211869 |