Penyaringan secara berkomputer elemen LTR retrotransposon di dalam genom manusia

Tujuan kajian ini adalah untuk menyaring retroelemen Gypsy dan Del daripada serangga Drosophila Melanogaster di dalam genom manusia. Retroelemen adalah eIemen bergerak yang mengandungi gen transkriptase berbalik. Elemen yang menggunakan perantara RNA ini boleh menyebabkan ketakstabilan genetik melal...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Main Author: Nurul Hidayah Mohamed Isa
Format: Academic Exercise
Language:English
Published: 2007
Online Access:https://eprints.ums.edu.my/id/eprint/7824/1/ae0000001657.pdf
https://eprints.ums.edu.my/id/eprint/7824/
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
id my.ums.eprints.7824
record_format eprints
spelling my.ums.eprints.78242017-10-10T06:28:22Z https://eprints.ums.edu.my/id/eprint/7824/ Penyaringan secara berkomputer elemen LTR retrotransposon di dalam genom manusia Nurul Hidayah Mohamed Isa Tujuan kajian ini adalah untuk menyaring retroelemen Gypsy dan Del daripada serangga Drosophila Melanogaster di dalam genom manusia. Retroelemen adalah eIemen bergerak yang mengandungi gen transkriptase berbalik. Elemen yang menggunakan perantara RNA ini boleh menyebabkan ketakstabilan genetik melalui mutasi penyisipan dan mutasi lain. Kaedah penyaringan yang digunakan adalah secara berkomputer. Retroelemen tersebut disaring di dalarn pangkalan data manusia. Retroelemen yang dipilih disusun dengan menggunakan dua cara; cara manual (penyusunan mata kasar) dan cara berkomputer (program c1ustalw). Pokok filogenetik khusus digunakan untuk melihat hubungan evolusi antara prob yang digunakan dengan retroelemen lain. Pokok ftlogeni universal pula digunakan untuk melihat hubungan antara retroelemen dan retrovirus. Daripada kajian sebanyak 773 elemen Gypsy dan 773 e1emen Del berjaya dipancing keluar daripada bank gen. Daripada jumlah ini hanya 100 e1emen Gypsy dan 100 e1emen Del dipertimbangkan. 28 elemen Gypsy dan 21 elemen Del disusun secara manual. Hanya 13 e1emen Gypsy dan 8 elemen Del disusun dengan menggunakan program clustalw dan pembinaan pokok filogenetik. Keputusan yang diperolehi daripada kajian ini menunjukkan retrolemen Gypsy dan Del pada serangga Drosophila Melanogaster ini telah dijumpai dalarn genom manusia. Kedua-dua elemen ini paling banyak didapati pada kromosom seks,X. Selain itu elemen-elemen ini turnt didapati dalam bilangan yang tinggi dalam kromosom autosom. Elemen Gypsy dijumpai di dalam kromosom pertama dan kedua. Elemen Del pula banyak terdapat pada kromosom kelima dan ketujuh. 2007 Academic Exercise NonPeerReviewed text en https://eprints.ums.edu.my/id/eprint/7824/1/ae0000001657.pdf Nurul Hidayah Mohamed Isa (2007) Penyaringan secara berkomputer elemen LTR retrotransposon di dalam genom manusia. Universiti Malaysia Sabah. (Unpublished)
institution Universiti Malaysia Sabah
building UMS Library
collection Institutional Repository
continent Asia
country Malaysia
content_provider Universiti Malaysia Sabah
content_source UMS Institutional Repository
url_provider http://eprints.ums.edu.my/
language English
description Tujuan kajian ini adalah untuk menyaring retroelemen Gypsy dan Del daripada serangga Drosophila Melanogaster di dalam genom manusia. Retroelemen adalah eIemen bergerak yang mengandungi gen transkriptase berbalik. Elemen yang menggunakan perantara RNA ini boleh menyebabkan ketakstabilan genetik melalui mutasi penyisipan dan mutasi lain. Kaedah penyaringan yang digunakan adalah secara berkomputer. Retroelemen tersebut disaring di dalarn pangkalan data manusia. Retroelemen yang dipilih disusun dengan menggunakan dua cara; cara manual (penyusunan mata kasar) dan cara berkomputer (program c1ustalw). Pokok filogenetik khusus digunakan untuk melihat hubungan evolusi antara prob yang digunakan dengan retroelemen lain. Pokok ftlogeni universal pula digunakan untuk melihat hubungan antara retroelemen dan retrovirus. Daripada kajian sebanyak 773 elemen Gypsy dan 773 e1emen Del berjaya dipancing keluar daripada bank gen. Daripada jumlah ini hanya 100 e1emen Gypsy dan 100 e1emen Del dipertimbangkan. 28 elemen Gypsy dan 21 elemen Del disusun secara manual. Hanya 13 e1emen Gypsy dan 8 elemen Del disusun dengan menggunakan program clustalw dan pembinaan pokok filogenetik. Keputusan yang diperolehi daripada kajian ini menunjukkan retrolemen Gypsy dan Del pada serangga Drosophila Melanogaster ini telah dijumpai dalarn genom manusia. Kedua-dua elemen ini paling banyak didapati pada kromosom seks,X. Selain itu elemen-elemen ini turnt didapati dalam bilangan yang tinggi dalam kromosom autosom. Elemen Gypsy dijumpai di dalam kromosom pertama dan kedua. Elemen Del pula banyak terdapat pada kromosom kelima dan ketujuh.
format Academic Exercise
author Nurul Hidayah Mohamed Isa
spellingShingle Nurul Hidayah Mohamed Isa
Penyaringan secara berkomputer elemen LTR retrotransposon di dalam genom manusia
author_facet Nurul Hidayah Mohamed Isa
author_sort Nurul Hidayah Mohamed Isa
title Penyaringan secara berkomputer elemen LTR retrotransposon di dalam genom manusia
title_short Penyaringan secara berkomputer elemen LTR retrotransposon di dalam genom manusia
title_full Penyaringan secara berkomputer elemen LTR retrotransposon di dalam genom manusia
title_fullStr Penyaringan secara berkomputer elemen LTR retrotransposon di dalam genom manusia
title_full_unstemmed Penyaringan secara berkomputer elemen LTR retrotransposon di dalam genom manusia
title_sort penyaringan secara berkomputer elemen ltr retrotransposon di dalam genom manusia
publishDate 2007
url https://eprints.ums.edu.my/id/eprint/7824/1/ae0000001657.pdf
https://eprints.ums.edu.my/id/eprint/7824/
_version_ 1760229225981280256
score 13.211869