Cover Image

Pencirian Kawasan Gen Polimerase (POL) Retrovirus Sclerosis berganda (MSRV) dengan menggunakan program Retrotector

Objektif bagi kajian ini adalah untuk mencirikan bahagian pol HERV-MSRV dengan menggunakan program RetroTector. Pencirian yang dilakukan adalah berdasarkan kepada motif-motif terpelihara yang ada di dalam bahagian pol tesebut. Selain itu, cars-cars pemasangan dan penggunaan serta kelebihan dan kele...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Main Author: Juinah Yanam
Format: Academic Exercise
Language:English
Published: Universiti Malaysia Sabah 2007
Subjects:
QD Chemistry
Online Access:https://eprints.ums.edu.my/id/eprint/22467/1/Pencirian%20Kawasan%20Gen%20Polimerase%20%28POL%29%20Retrovirus%20Sclerosis%20berganda%20%28MSRV%29%20dengan%20menggunakan%20program%20Retrotector.pdf
https://eprints.ums.edu.my/id/eprint/22467/
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
id my.ums.eprints.22467
record_format eprints
spelling my.ums.eprints.224672019-07-09T23:47:48Z https://eprints.ums.edu.my/id/eprint/22467/ Pencirian Kawasan Gen Polimerase (POL) Retrovirus Sclerosis berganda (MSRV) dengan menggunakan program Retrotector Juinah Yanam QD Chemistry Objektif bagi kajian ini adalah untuk mencirikan bahagian pol HERV-MSRV dengan menggunakan program RetroTector. Pencirian yang dilakukan adalah berdasarkan kepada motif-motif terpelihara yang ada di dalam bahagian pol tesebut. Selain itu, cars-cars pemasangan dan penggunaan serta kelebihan dan kelemahan RetroTector juga turut dikaji. Terdapat 5 langkah utama yang terlibat dalam kajian ini, iaitu mendapatkan motif-motif terpelihara secara manual daripada bank gen sebagai langkah pertama, dan diikuti dengan langkah kajian tentang keperluan dan cara-cars pemasangan RetroTector ke dalam sistem komputer. Seterusnya adalah mendapatkan motif-motif terpelihara dengan menggunakan program RetroTector. Selepas itu, motif-motif terpelihara yang diperolehi secara manual dengan motif-motif terpelihara yang diperolehi melalui program RetroTector dibandingkan. Sebagai langkah terakhir, ujian sensitiviti program RetroTector dijalankan. Didapati bahagian pol MSRV mengandungi sembilan jenis motif terpelihara. laitu dua motif pada gen protease, enam motif pada gen RT dan satu motif pada gen integrase. Motif-motif terpelihara yang diperolehi melalui RetroTector adalah hampir sama dengan motif-motif terpelihara yang diperolehi secara manual daripada bank gen, terutamanya motif terpelihara bagi gen protease dan gen integrase. Bagi gen transkriptase berbalik, terdapat sedikit perbezaan dimana motif terpelihara bagi domain kedua, iaitu QDLR, yang diperolehi secara manual tidak diperolehi melalui RetroTector. Sebaliknya, satu motif lain, iaitu GYKVSKPKAR, telah diperolehi. Secara keseluruhannya, program RetroTector, apabila digabungkan dengan kaedah manual, berpotensi menjadi salah satu perkakas bioinformatik yang penting yang dapat memberi banyak kelebihan kepada penggunanya dalam mencirikan retrovirus endogenus manusia Universiti Malaysia Sabah 2007 Academic Exercise NonPeerReviewed text en https://eprints.ums.edu.my/id/eprint/22467/1/Pencirian%20Kawasan%20Gen%20Polimerase%20%28POL%29%20Retrovirus%20Sclerosis%20berganda%20%28MSRV%29%20dengan%20menggunakan%20program%20Retrotector.pdf Juinah Yanam (2007) Pencirian Kawasan Gen Polimerase (POL) Retrovirus Sclerosis berganda (MSRV) dengan menggunakan program Retrotector. Universiti Malaysia Sabah.
institution Universiti Malaysia Sabah
building UMS Library
collection Institutional Repository
continent Asia
country Malaysia
content_provider Universiti Malaysia Sabah
content_source UMS Institutional Repository
url_provider http://eprints.ums.edu.my/
language English
topic QD Chemistry
spellingShingle QD Chemistry
Juinah Yanam
Pencirian Kawasan Gen Polimerase (POL) Retrovirus Sclerosis berganda (MSRV) dengan menggunakan program Retrotector
description Objektif bagi kajian ini adalah untuk mencirikan bahagian pol HERV-MSRV dengan menggunakan program RetroTector. Pencirian yang dilakukan adalah berdasarkan kepada motif-motif terpelihara yang ada di dalam bahagian pol tesebut. Selain itu, cars-cars pemasangan dan penggunaan serta kelebihan dan kelemahan RetroTector juga turut dikaji. Terdapat 5 langkah utama yang terlibat dalam kajian ini, iaitu mendapatkan motif-motif terpelihara secara manual daripada bank gen sebagai langkah pertama, dan diikuti dengan langkah kajian tentang keperluan dan cara-cars pemasangan RetroTector ke dalam sistem komputer. Seterusnya adalah mendapatkan motif-motif terpelihara dengan menggunakan program RetroTector. Selepas itu, motif-motif terpelihara yang diperolehi secara manual dengan motif-motif terpelihara yang diperolehi melalui program RetroTector dibandingkan. Sebagai langkah terakhir, ujian sensitiviti program RetroTector dijalankan. Didapati bahagian pol MSRV mengandungi sembilan jenis motif terpelihara. laitu dua motif pada gen protease, enam motif pada gen RT dan satu motif pada gen integrase. Motif-motif terpelihara yang diperolehi melalui RetroTector adalah hampir sama dengan motif-motif terpelihara yang diperolehi secara manual daripada bank gen, terutamanya motif terpelihara bagi gen protease dan gen integrase. Bagi gen transkriptase berbalik, terdapat sedikit perbezaan dimana motif terpelihara bagi domain kedua, iaitu QDLR, yang diperolehi secara manual tidak diperolehi melalui RetroTector. Sebaliknya, satu motif lain, iaitu GYKVSKPKAR, telah diperolehi. Secara keseluruhannya, program RetroTector, apabila digabungkan dengan kaedah manual, berpotensi menjadi salah satu perkakas bioinformatik yang penting yang dapat memberi banyak kelebihan kepada penggunanya dalam mencirikan retrovirus endogenus manusia
format Academic Exercise
author Juinah Yanam
author_facet Juinah Yanam
author_sort Juinah Yanam
title Pencirian Kawasan Gen Polimerase (POL) Retrovirus Sclerosis berganda (MSRV) dengan menggunakan program Retrotector
title_short Pencirian Kawasan Gen Polimerase (POL) Retrovirus Sclerosis berganda (MSRV) dengan menggunakan program Retrotector
title_full Pencirian Kawasan Gen Polimerase (POL) Retrovirus Sclerosis berganda (MSRV) dengan menggunakan program Retrotector
title_fullStr Pencirian Kawasan Gen Polimerase (POL) Retrovirus Sclerosis berganda (MSRV) dengan menggunakan program Retrotector
title_full_unstemmed Pencirian Kawasan Gen Polimerase (POL) Retrovirus Sclerosis berganda (MSRV) dengan menggunakan program Retrotector
title_sort pencirian kawasan gen polimerase (pol) retrovirus sclerosis berganda (msrv) dengan menggunakan program retrotector
publisher Universiti Malaysia Sabah
publishDate 2007
url https://eprints.ums.edu.my/id/eprint/22467/1/Pencirian%20Kawasan%20Gen%20Polimerase%20%28POL%29%20Retrovirus%20Sclerosis%20berganda%20%28MSRV%29%20dengan%20menggunakan%20program%20Retrotector.pdf
https://eprints.ums.edu.my/id/eprint/22467/
_version_ 1760229972395425792
score 13.211869

Similar Items